El examen físico es una de las partes de la historia clínica. Es la exploración que se le practica al paciente para reconocer alteraciones provocadas por la enfermedad. El examen funcional (motor-sensitivo) tiene el objetivo de evaluar la inervación de las estructuras examinadas. Se realizó un estudio observacional, descriptivo, transversal, con estudiantes de tercer año de Estomatología, de la Sede San Antonio de los Baños, Facultad de Ciencias Médicas Artemisa, en Octubre del 2020, con el objetivo de identificar dificultades en la realización del examen funcional, durante la confección de la Historia Clínica Bucal Individual. El universo estuvo constituido por 12 estudiantes, la muestra coincidió con el universo. Se emplearon métodos teóricos: análisis-síntesis e inductivo-deductivo, empíricos: observación. Se estudiaron las variables: realización del examen físico del Sistema Nervioso (SN), métodos básicos de exploración, dificultades para realizar la exploración de los nervios que inervan estructuras del aparato masticatorio, otros nervios y estructuras del SN y para describir manifestaciones clínicas de su lesión. Los datos obtenidos se procesaron manualmente y se plasmaron en tablas. Las variables se resumieron en frecuencias absolutas y relativas. Existen dificultades en el conocimiento de la inervación de las estructuras del aparato masticatorio y músculos de cabeza y cuello, al realizar el examen físico del SN, mencionar los métodos empleados para ello, realizar la exploración física de los nervios que inervan estructuras del aparato masticatorio y para describir manifestaciones clínicas de la lesión nerviosa. Se debe trabajar más en integrar los contenidos básicos con la clínica.Palabras claves: Historia Clínica, examen físico, examen funcional motor-sensitivo,